Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPTAN1Q13813 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTAN1Q13813 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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