Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MADCAM1Q13477 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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