Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLEQ07864 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLEQ07864 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLEQ07864 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLEQ07864 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLEQ07864 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLEQ07864 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLEQ07864 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLEQ07864 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLEQ07864 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLEQ07864 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLEQ07864 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
POLEQ07864 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLEQ07864 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLEQ07864 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLEQ07864 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLEQ07864 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLEQ07864 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLEQ07864 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLEQ07864 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLEQ07864 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLEQ07864 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLEQ07864 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLEQ07864 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLEQ07864 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLEQ07864 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLEQ07864 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLEQ07864 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLEQ07864 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLEQ07864 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLEQ07864 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLEQ07864 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLEQ07864 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLEQ07864 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLEQ07864 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLEQ07864 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLEQ07864 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLEQ07864 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLEQ07864 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLEQ07864 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLEQ07864 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLEQ07864 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLEQ07864 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLEQ07864 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLEQ07864 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLEQ07864 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLEQ07864 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLEQ07864 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLEQ07864 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLEQ07864 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLEQ07864 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLEQ07864 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLEQ07864 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLEQ07864 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLEQ07864 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLEQ07864 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLEQ07864 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLEQ07864 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLEQ07864 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLEQ07864 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLEQ07864 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLEQ07864 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLEQ07864 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLEQ07864 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLEQ07864 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLEQ07864 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLEQ07864 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLEQ07864 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLEQ07864 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLEQ07864 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLEQ07864 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLEQ07864 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLEQ07864 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms