Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBX1P67809 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBX1P67809 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
YBX1P67809 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBX1P67809 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBX1P67809 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBX1P67809 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBX1P67809 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YBX1P67809 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBX1P67809 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBX1P67809 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBX1P67809 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBX1P67809 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBX1P67809 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBX1P67809 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBX1P67809 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBX1P67809 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBX1P67809 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YBX1P67809 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YBX1P67809 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBX1P67809 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBX1P67809 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBX1P67809 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBX1P67809 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBX1P67809 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBX1P67809 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBX1P67809 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YBX1P67809 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
YBX1P67809 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBX1P67809 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBX1P67809 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBX1P67809 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBX1P67809 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YBX1P67809 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBX1P67809 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBX1P67809 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBX1P67809 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBX1P67809 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YBX1P67809 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBX1P67809 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBX1P67809 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBX1P67809 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBX1P67809 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX1P67809 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX1P67809 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX1P67809 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX1P67809 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX1P67809 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX1P67809 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX1P67809 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX1P67809 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX1P67809 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX1P67809 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX1P67809 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX1P67809 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX1P67809 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX1P67809 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX1P67809 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX1P67809 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX1P67809 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX1P67809 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX1P67809 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX1P67809 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX1P67809 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX1P67809 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX1P67809 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YBX1P67809 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
YBX1P67809 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YBX1P67809 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YBX1P67809 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX1P67809 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX1P67809 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX1P67809 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX1P67809 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX1P67809 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX1P67809 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX1P67809 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms