Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VBP1P61758 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VBP1P61758 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VBP1P61758 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VBP1P61758 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VBP1P61758 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VBP1P61758 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VBP1P61758 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VBP1P61758 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VBP1P61758 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VBP1P61758 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VBP1P61758 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VBP1P61758 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VBP1P61758 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VBP1P61758 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VBP1P61758 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VBP1P61758 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VBP1P61758 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VBP1P61758 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VBP1P61758 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VBP1P61758 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VBP1P61758 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VBP1P61758 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VBP1P61758 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VBP1P61758 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VBP1P61758 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VBP1P61758 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VBP1P61758 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VBP1P61758 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VBP1P61758 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VBP1P61758 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VBP1P61758 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VBP1P61758 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VBP1P61758 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VBP1P61758 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VBP1P61758 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VBP1P61758 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VBP1P61758 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VBP1P61758 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VBP1P61758 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VBP1P61758 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VBP1P61758 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VBP1P61758 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VBP1P61758 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VBP1P61758 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VBP1P61758 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VBP1P61758 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VBP1P61758 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VBP1P61758 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VBP1P61758 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VBP1P61758 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VBP1P61758 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VBP1P61758 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VBP1P61758 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VBP1P61758 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VBP1P61758 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VBP1P61758 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VBP1P61758 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VBP1P61758 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VBP1P61758 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VBP1P61758 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VBP1P61758 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VBP1P61758 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms