Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GTF2A2P52657 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2A2P52657 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms