Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMC4P43686 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMC4P43686 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC4P43686 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC4P43686 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms