Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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