Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGTLC3B5MD39 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GGTLC3B5MD39 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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