Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CGGBP1Q9UFW8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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