Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TREX1Q9NSU2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREX1Q9NSU2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms