Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GINS3Q9BRX5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms