Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SGIP1Q9BQI5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SGIP1Q9BQI5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SGIP1Q9BQI5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SGIP1Q9BQI5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms