Protein–RNA interactions for Protein: Q96HC4

PDLIM5, PDZ and LIM domain protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5Q96HC4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM5Q96HC4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM5Q96HC4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDLIM5Q96HC4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms