Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLUAP1Q96AJ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLUAP1Q96AJ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLUAP1Q96AJ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLUAP1Q96AJ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLUAP1Q96AJ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLUAP1Q96AJ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms