Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.97
LTBP4Q8N2S1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LTBP4Q8N2S1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LTBP4Q8N2S1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms