Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP2LQ8IYA6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CKAP2LQ8IYA6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms