Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZC3H12AQ5D1E8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12AQ5D1E8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.5 ms