Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1CQ13936 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1CQ13936 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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