Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCGB2A2Q13296 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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SCGB2A2Q13296 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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SCGB2A2Q13296 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB2A2Q13296 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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