Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF3Q13114 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAF3Q13114 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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