Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD1Q02809 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLOD1Q02809 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD1Q02809 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms