Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATN1P54259 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATN1P54259 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATN1P54259 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATN1P54259 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATN1P54259 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATN1P54259 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATN1P54259 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATN1P54259 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATN1P54259 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATN1P54259 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATN1P54259 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATN1P54259 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATN1P54259 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATN1P54259 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATN1P54259 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATN1P54259 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATN1P54259 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATN1P54259 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATN1P54259 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATN1P54259 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATN1P54259 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATN1P54259 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATN1P54259 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATN1P54259 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATN1P54259 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATN1P54259 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATN1P54259 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATN1P54259 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATN1P54259 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATN1P54259 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATN1P54259 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATN1P54259 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATN1P54259 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATN1P54259 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATN1P54259 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATN1P54259 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATN1P54259 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATN1P54259 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATN1P54259 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATN1P54259 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATN1P54259 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATN1P54259 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATN1P54259 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATN1P54259 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATN1P54259 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATN1P54259 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATN1P54259 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATN1P54259 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATN1P54259 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATN1P54259 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATN1P54259 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATN1P54259 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATN1P54259 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATN1P54259 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATN1P54259 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATN1P54259 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATN1P54259 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATN1P54259 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATN1P54259 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATN1P54259 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATN1P54259 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATN1P54259 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATN1P54259 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATN1P54259 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATN1P54259 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATN1P54259 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATN1P54259 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATN1P54259 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATN1P54259 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATN1P54259 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATN1P54259 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATN1P54259 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATN1P54259 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATN1P54259 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATN1P54259 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATN1P54259 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATN1P54259 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATN1P54259 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATN1P54259 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATN1P54259 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATN1P54259 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATN1P54259 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATN1P54259 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATN1P54259 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATN1P54259 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATN1P54259 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATN1P54259 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATN1P54259 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATN1P54259 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATN1P54259 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATN1P54259 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATN1P54259 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATN1P54259 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATN1P54259 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATN1P54259 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATN1P54259 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATN1P54259 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATN1P54259 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATN1P54259 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms