Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PKHD1P08F94 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKHD1P08F94 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKHD1P08F94 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms