Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN7O95471 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN7O95471 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN7O95471 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms