Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HCN4Q9Y3Q4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HCN4Q9Y3Q4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HCN4Q9Y3Q4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HCN4Q9Y3Q4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HCN4Q9Y3Q4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HCN4Q9Y3Q4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HCN4Q9Y3Q4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HCN4Q9Y3Q4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HCN4Q9Y3Q4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HCN4Q9Y3Q4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HCN4Q9Y3Q4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HCN4Q9Y3Q4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HCN4Q9Y3Q4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HCN4Q9Y3Q4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HCN4Q9Y3Q4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HCN4Q9Y3Q4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
HCN4Q9Y3Q4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HCN4Q9Y3Q4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HCN4Q9Y3Q4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HCN4Q9Y3Q4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HCN4Q9Y3Q4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HCN4Q9Y3Q4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HCN4Q9Y3Q4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HCN4Q9Y3Q4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HCN4Q9Y3Q4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HCN4Q9Y3Q4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HCN4Q9Y3Q4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HCN4Q9Y3Q4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HCN4Q9Y3Q4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HCN4Q9Y3Q4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HCN4Q9Y3Q4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
HCN4Q9Y3Q4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HCN4Q9Y3Q4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HCN4Q9Y3Q4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HCN4Q9Y3Q4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
HCN4Q9Y3Q4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HCN4Q9Y3Q4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HCN4Q9Y3Q4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
HCN4Q9Y3Q4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HCN4Q9Y3Q4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HCN4Q9Y3Q4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HCN4Q9Y3Q4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HCN4Q9Y3Q4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HCN4Q9Y3Q4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HCN4Q9Y3Q4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HCN4Q9Y3Q4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HCN4Q9Y3Q4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HCN4Q9Y3Q4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HCN4Q9Y3Q4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HCN4Q9Y3Q4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HCN4Q9Y3Q4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HCN4Q9Y3Q4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HCN4Q9Y3Q4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HCN4Q9Y3Q4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HCN4Q9Y3Q4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HCN4Q9Y3Q4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HCN4Q9Y3Q4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HCN4Q9Y3Q4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HCN4Q9Y3Q4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HCN4Q9Y3Q4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HCN4Q9Y3Q4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HCN4Q9Y3Q4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HCN4Q9Y3Q4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HCN4Q9Y3Q4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
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HCN4Q9Y3Q4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HCN4Q9Y3Q4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HCN4Q9Y3Q4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HCN4Q9Y3Q4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HCN4Q9Y3Q4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HCN4Q9Y3Q4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HCN4Q9Y3Q4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HCN4Q9Y3Q4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HCN4Q9Y3Q4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HCN4Q9Y3Q4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HCN4Q9Y3Q4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HCN4Q9Y3Q4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HCN4Q9Y3Q4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HCN4Q9Y3Q4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HCN4Q9Y3Q4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HCN4Q9Y3Q4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HCN4Q9Y3Q4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HCN4Q9Y3Q4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HCN4Q9Y3Q4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HCN4Q9Y3Q4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HCN4Q9Y3Q4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HCN4Q9Y3Q4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HCN4Q9Y3Q4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HCN4Q9Y3Q4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HCN4Q9Y3Q4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HCN4Q9Y3Q4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HCN4Q9Y3Q4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HCN4Q9Y3Q4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HCN4Q9Y3Q4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HCN4Q9Y3Q4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HCN4Q9Y3Q4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
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