Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBLCQ9ULV8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBLCQ9ULV8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBLCQ9ULV8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBLCQ9ULV8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBLCQ9ULV8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CBLCQ9ULV8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBLCQ9ULV8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBLCQ9ULV8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBLCQ9ULV8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBLCQ9ULV8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBLCQ9ULV8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBLCQ9ULV8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBLCQ9ULV8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBLCQ9ULV8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBLCQ9ULV8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBLCQ9ULV8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBLCQ9ULV8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBLCQ9ULV8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBLCQ9ULV8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBLCQ9ULV8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBLCQ9ULV8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBLCQ9ULV8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CBLCQ9ULV8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBLCQ9ULV8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBLCQ9ULV8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CBLCQ9ULV8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBLCQ9ULV8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBLCQ9ULV8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBLCQ9ULV8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBLCQ9ULV8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CBLCQ9ULV8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CBLCQ9ULV8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBLCQ9ULV8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CBLCQ9ULV8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBLCQ9ULV8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBLCQ9ULV8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBLCQ9ULV8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBLCQ9ULV8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBLCQ9ULV8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBLCQ9ULV8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBLCQ9ULV8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBLCQ9ULV8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBLCQ9ULV8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBLCQ9ULV8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBLCQ9ULV8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBLCQ9ULV8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBLCQ9ULV8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CBLCQ9ULV8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBLCQ9ULV8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBLCQ9ULV8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBLCQ9ULV8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBLCQ9ULV8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBLCQ9ULV8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBLCQ9ULV8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBLCQ9ULV8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBLCQ9ULV8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBLCQ9ULV8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBLCQ9ULV8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBLCQ9ULV8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBLCQ9ULV8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBLCQ9ULV8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBLCQ9ULV8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CBLCQ9ULV8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBLCQ9ULV8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBLCQ9ULV8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBLCQ9ULV8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBLCQ9ULV8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBLCQ9ULV8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBLCQ9ULV8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CBLCQ9ULV8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBLCQ9ULV8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBLCQ9ULV8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBLCQ9ULV8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBLCQ9ULV8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBLCQ9ULV8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBLCQ9ULV8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBLCQ9ULV8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBLCQ9ULV8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBLCQ9ULV8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBLCQ9ULV8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBLCQ9ULV8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBLCQ9ULV8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBLCQ9ULV8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBLCQ9ULV8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBLCQ9ULV8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBLCQ9ULV8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBLCQ9ULV8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms