Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD3Q9UJU5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD3Q9UJU5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD3Q9UJU5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD3Q9UJU5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD3Q9UJU5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD3Q9UJU5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD3Q9UJU5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FOXD3Q9UJU5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD3Q9UJU5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD3Q9UJU5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD3Q9UJU5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD3Q9UJU5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD3Q9UJU5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD3Q9UJU5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD3Q9UJU5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD3Q9UJU5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD3Q9UJU5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD3Q9UJU5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD3Q9UJU5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD3Q9UJU5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD3Q9UJU5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD3Q9UJU5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD3Q9UJU5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD3Q9UJU5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD3Q9UJU5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD3Q9UJU5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD3Q9UJU5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD3Q9UJU5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD3Q9UJU5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD3Q9UJU5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD3Q9UJU5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD3Q9UJU5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD3Q9UJU5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD3Q9UJU5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOXD3Q9UJU5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD3Q9UJU5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD3Q9UJU5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD3Q9UJU5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD3Q9UJU5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD3Q9UJU5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD3Q9UJU5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD3Q9UJU5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXD3Q9UJU5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXD3Q9UJU5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXD3Q9UJU5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD3Q9UJU5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXD3Q9UJU5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD3Q9UJU5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD3Q9UJU5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD3Q9UJU5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD3Q9UJU5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD3Q9UJU5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD3Q9UJU5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD3Q9UJU5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD3Q9UJU5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD3Q9UJU5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD3Q9UJU5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD3Q9UJU5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD3Q9UJU5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD3Q9UJU5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD3Q9UJU5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD3Q9UJU5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD3Q9UJU5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD3Q9UJU5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD3Q9UJU5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD3Q9UJU5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD3Q9UJU5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD3Q9UJU5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD3Q9UJU5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD3Q9UJU5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD3Q9UJU5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD3Q9UJU5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD3Q9UJU5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD3Q9UJU5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD3Q9UJU5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD3Q9UJU5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXD3Q9UJU5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD3Q9UJU5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD3Q9UJU5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD3Q9UJU5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD3Q9UJU5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD3Q9UJU5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD3Q9UJU5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD3Q9UJU5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD3Q9UJU5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD3Q9UJU5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD3Q9UJU5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD3Q9UJU5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms