Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DDX20Q9UHI6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DDX20Q9UHI6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DDX20Q9UHI6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DDX20Q9UHI6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DDX20Q9UHI6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DDX20Q9UHI6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DDX20Q9UHI6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
DDX20Q9UHI6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DDX20Q9UHI6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DDX20Q9UHI6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DDX20Q9UHI6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DDX20Q9UHI6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DDX20Q9UHI6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DDX20Q9UHI6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDX20Q9UHI6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDX20Q9UHI6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DDX20Q9UHI6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DDX20Q9UHI6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
DDX20Q9UHI6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DDX20Q9UHI6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DDX20Q9UHI6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DDX20Q9UHI6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDX20Q9UHI6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
DDX20Q9UHI6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
DDX20Q9UHI6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DDX20Q9UHI6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDX20Q9UHI6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
DDX20Q9UHI6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DDX20Q9UHI6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDX20Q9UHI6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDX20Q9UHI6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX20Q9UHI6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDX20Q9UHI6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDX20Q9UHI6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDX20Q9UHI6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DDX20Q9UHI6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
DDX20Q9UHI6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
DDX20Q9UHI6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DDX20Q9UHI6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDX20Q9UHI6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX20Q9UHI6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX20Q9UHI6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX20Q9UHI6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDX20Q9UHI6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDX20Q9UHI6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDX20Q9UHI6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX20Q9UHI6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX20Q9UHI6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX20Q9UHI6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX20Q9UHI6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX20Q9UHI6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX20Q9UHI6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDX20Q9UHI6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDX20Q9UHI6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDX20Q9UHI6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDX20Q9UHI6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDX20Q9UHI6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDX20Q9UHI6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DDX20Q9UHI6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DDX20Q9UHI6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DDX20Q9UHI6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDX20Q9UHI6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDX20Q9UHI6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DDX20Q9UHI6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDX20Q9UHI6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDX20Q9UHI6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDX20Q9UHI6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDX20Q9UHI6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDX20Q9UHI6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DDX20Q9UHI6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDX20Q9UHI6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX20Q9UHI6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX20Q9UHI6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDX20Q9UHI6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDX20Q9UHI6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDX20Q9UHI6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DDX20Q9UHI6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DDX20Q9UHI6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DDX20Q9UHI6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DDX20Q9UHI6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX20Q9UHI6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DDX20Q9UHI6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDX20Q9UHI6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DDX20Q9UHI6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
DDX20Q9UHI6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DDX20Q9UHI6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
DDX20Q9UHI6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DDX20Q9UHI6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DDX20Q9UHI6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX20Q9UHI6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX20Q9UHI6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX20Q9UHI6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX20Q9UHI6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX20Q9UHI6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX20Q9UHI6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX20Q9UHI6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX20Q9UHI6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX20Q9UHI6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX20Q9UHI6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms