Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA2D2Q9NY47 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA2D2Q9NY47 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNA2D2Q9NY47 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNA2D2Q9NY47 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNA2D2Q9NY47 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNA2D2Q9NY47 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNA2D2Q9NY47 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CACNA2D2Q9NY47 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNA2D2Q9NY47 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA2D2Q9NY47 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CACNA2D2Q9NY47 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA2D2Q9NY47 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNA2D2Q9NY47 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CACNA2D2Q9NY47 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNA2D2Q9NY47 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA2D2Q9NY47 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA2D2Q9NY47 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA2D2Q9NY47 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA2D2Q9NY47 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA2D2Q9NY47 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNA2D2Q9NY47 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNA2D2Q9NY47 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNA2D2Q9NY47 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA2D2Q9NY47 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA2D2Q9NY47 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNA2D2Q9NY47 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNA2D2Q9NY47 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA2D2Q9NY47 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA2D2Q9NY47 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA2D2Q9NY47 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA2D2Q9NY47 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA2D2Q9NY47 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CACNA2D2Q9NY47 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA2D2Q9NY47 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNA2D2Q9NY47 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNA2D2Q9NY47 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNA2D2Q9NY47 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNA2D2Q9NY47 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA2D2Q9NY47 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA2D2Q9NY47 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA2D2Q9NY47 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA2D2Q9NY47 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNA2D2Q9NY47 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA2D2Q9NY47 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA2D2Q9NY47 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA2D2Q9NY47 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA2D2Q9NY47 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA2D2Q9NY47 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA2D2Q9NY47 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA2D2Q9NY47 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA2D2Q9NY47 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA2D2Q9NY47 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA2D2Q9NY47 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA2D2Q9NY47 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA2D2Q9NY47 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA2D2Q9NY47 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA2D2Q9NY47 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA2D2Q9NY47 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA2D2Q9NY47 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA2D2Q9NY47 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA2D2Q9NY47 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA2D2Q9NY47 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNA2D2Q9NY47 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA2D2Q9NY47 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA2D2Q9NY47 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA2D2Q9NY47 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNA2D2Q9NY47 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNA2D2Q9NY47 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CACNA2D2Q9NY47 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA2D2Q9NY47 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA2D2Q9NY47 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA2D2Q9NY47 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA2D2Q9NY47 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNA2D2Q9NY47 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D2Q9NY47 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNA2D2Q9NY47 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA2D2Q9NY47 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA2D2Q9NY47 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA2D2Q9NY47 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA2D2Q9NY47 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA2D2Q9NY47 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA2D2Q9NY47 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA2D2Q9NY47 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA2D2Q9NY47 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA2D2Q9NY47 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA2D2Q9NY47 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA2D2Q9NY47 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D2Q9NY47 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D2Q9NY47 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA2D2Q9NY47 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA2D2Q9NY47 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CACNA2D2Q9NY47 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA2D2Q9NY47 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA2D2Q9NY47 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA2D2Q9NY47 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms