Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF3Q9NR81 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF3Q9NR81 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF3Q9NR81 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF3Q9NR81 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF3Q9NR81 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ARHGEF3Q9NR81 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF3Q9NR81 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF3Q9NR81 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARHGEF3Q9NR81 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF3Q9NR81 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF3Q9NR81 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF3Q9NR81 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF3Q9NR81 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARHGEF3Q9NR81 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGEF3Q9NR81 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARHGEF3Q9NR81 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARHGEF3Q9NR81 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARHGEF3Q9NR81 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARHGEF3Q9NR81 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARHGEF3Q9NR81 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARHGEF3Q9NR81 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARHGEF3Q9NR81 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARHGEF3Q9NR81 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ARHGEF3Q9NR81 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF3Q9NR81 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF3Q9NR81 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF3Q9NR81 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3Q9NR81 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3Q9NR81 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF3Q9NR81 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF3Q9NR81 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF3Q9NR81 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF3Q9NR81 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF3Q9NR81 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF3Q9NR81 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF3Q9NR81 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF3Q9NR81 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF3Q9NR81 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF3Q9NR81 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF3Q9NR81 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF3Q9NR81 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF3Q9NR81 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF3Q9NR81 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF3Q9NR81 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF3Q9NR81 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF3Q9NR81 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF3Q9NR81 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF3Q9NR81 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARHGEF3Q9NR81 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF3Q9NR81 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF3Q9NR81 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF3Q9NR81 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF3Q9NR81 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF3Q9NR81 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF3Q9NR81 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF3Q9NR81 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF3Q9NR81 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF3Q9NR81 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF3Q9NR81 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF3Q9NR81 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF3Q9NR81 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF3Q9NR81 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGEF3Q9NR81 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGEF3Q9NR81 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGEF3Q9NR81 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARHGEF3Q9NR81 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARHGEF3Q9NR81 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARHGEF3Q9NR81 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ARHGEF3Q9NR81 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF3Q9NR81 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF3Q9NR81 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF3Q9NR81 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF3Q9NR81 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF3Q9NR81 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF3Q9NR81 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF3Q9NR81 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF3Q9NR81 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF3Q9NR81 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGEF3Q9NR81 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARHGEF3Q9NR81 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARHGEF3Q9NR81 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARHGEF3Q9NR81 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARHGEF3Q9NR81 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGEF3Q9NR81 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGEF3Q9NR81 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF3Q9NR81 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF3Q9NR81 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF3Q9NR81 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF3Q9NR81 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF3Q9NR81 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARHGEF3Q9NR81 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ARHGEF3Q9NR81 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARHGEF3Q9NR81 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARHGEF3Q9NR81 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF3Q9NR81 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGEF3Q9NR81 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF3Q9NR81 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
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