Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCH0

NCKAP5L, Nck-associated protein 5-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP5LQ9HCH0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
NCKAP5LQ9HCH0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
NCKAP5LQ9HCH0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.33■■■■■ 4.53
NCKAP5LQ9HCH0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
NCKAP5LQ9HCH0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
NCKAP5LQ9HCH0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
NCKAP5LQ9HCH0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NCKAP5LQ9HCH0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
NCKAP5LQ9HCH0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
NCKAP5LQ9HCH0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NCKAP5LQ9HCH0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NCKAP5LQ9HCH0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
NCKAP5LQ9HCH0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43■■■■■ 4.47
NCKAP5LQ9HCH0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
NCKAP5LQ9HCH0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
NCKAP5LQ9HCH0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NCKAP5LQ9HCH0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
NCKAP5LQ9HCH0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
NCKAP5LQ9HCH0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
NCKAP5LQ9HCH0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
NCKAP5LQ9HCH0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
NCKAP5LQ9HCH0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
NCKAP5LQ9HCH0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
NCKAP5LQ9HCH0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
NCKAP5LQ9HCH0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
NCKAP5LQ9HCH0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NCKAP5LQ9HCH0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
NCKAP5LQ9HCH0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
NCKAP5LQ9HCH0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NCKAP5LQ9HCH0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
NCKAP5LQ9HCH0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
NCKAP5LQ9HCH0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
NCKAP5LQ9HCH0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
NCKAP5LQ9HCH0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
NCKAP5LQ9HCH0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NCKAP5LQ9HCH0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
NCKAP5LQ9HCH0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NCKAP5LQ9HCH0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
NCKAP5LQ9HCH0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
NCKAP5LQ9HCH0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
NCKAP5LQ9HCH0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
NCKAP5LQ9HCH0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
NCKAP5LQ9HCH0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
NCKAP5LQ9HCH0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
NCKAP5LQ9HCH0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
NCKAP5LQ9HCH0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
NCKAP5LQ9HCH0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
NCKAP5LQ9HCH0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
NCKAP5LQ9HCH0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
NCKAP5LQ9HCH0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
NCKAP5LQ9HCH0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
NCKAP5LQ9HCH0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
NCKAP5LQ9HCH0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
NCKAP5LQ9HCH0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
NCKAP5LQ9HCH0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
NCKAP5LQ9HCH0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NCKAP5LQ9HCH0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
NCKAP5LQ9HCH0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NCKAP5LQ9HCH0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
NCKAP5LQ9HCH0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
NCKAP5LQ9HCH0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NCKAP5LQ9HCH0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
NCKAP5LQ9HCH0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42■■■■■ 4.31
NCKAP5LQ9HCH0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
NCKAP5LQ9HCH0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NCKAP5LQ9HCH0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NCKAP5LQ9HCH0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
NCKAP5LQ9HCH0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
NCKAP5LQ9HCH0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
NCKAP5LQ9HCH0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
NCKAP5LQ9HCH0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NCKAP5LQ9HCH0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.85■■■■■ 4.29
NCKAP5LQ9HCH0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NCKAP5LQ9HCH0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
NCKAP5LQ9HCH0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NCKAP5LQ9HCH0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NCKAP5LQ9HCH0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NCKAP5LQ9HCH0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NCKAP5LQ9HCH0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
NCKAP5LQ9HCH0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NCKAP5LQ9HCH0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
NCKAP5LQ9HCH0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
NCKAP5LQ9HCH0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
NCKAP5LQ9HCH0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
NCKAP5LQ9HCH0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
NCKAP5LQ9HCH0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
NCKAP5LQ9HCH0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NCKAP5LQ9HCH0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
NCKAP5LQ9HCH0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NCKAP5LQ9HCH0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
NCKAP5LQ9HCH0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
NCKAP5LQ9HCH0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
NCKAP5LQ9HCH0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
NCKAP5LQ9HCH0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NCKAP5LQ9HCH0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
NCKAP5LQ9HCH0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NCKAP5LQ9HCH0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NCKAP5LQ9HCH0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
NCKAP5LQ9HCH0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
NCKAP5LQ9HCH0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms