Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA4CQ9C0C4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA4CQ9C0C4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4CQ9C0C4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA4CQ9C0C4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA4CQ9C0C4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA4CQ9C0C4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA4CQ9C0C4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4CQ9C0C4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4CQ9C0C4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA4CQ9C0C4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA4CQ9C0C4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SEMA4CQ9C0C4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA4CQ9C0C4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA4CQ9C0C4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA4CQ9C0C4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA4CQ9C0C4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA4CQ9C0C4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA4CQ9C0C4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA4CQ9C0C4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4CQ9C0C4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4CQ9C0C4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA4CQ9C0C4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA4CQ9C0C4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA4CQ9C0C4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA4CQ9C0C4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA4CQ9C0C4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA4CQ9C0C4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA4CQ9C0C4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA4CQ9C0C4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA4CQ9C0C4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA4CQ9C0C4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA4CQ9C0C4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA4CQ9C0C4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA4CQ9C0C4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA4CQ9C0C4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA4CQ9C0C4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA4CQ9C0C4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA4CQ9C0C4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA4CQ9C0C4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA4CQ9C0C4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA4CQ9C0C4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA4CQ9C0C4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA4CQ9C0C4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA4CQ9C0C4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA4CQ9C0C4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA4CQ9C0C4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA4CQ9C0C4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA4CQ9C0C4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA4CQ9C0C4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA4CQ9C0C4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA4CQ9C0C4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4CQ9C0C4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4CQ9C0C4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4CQ9C0C4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA4CQ9C0C4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA4CQ9C0C4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA4CQ9C0C4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA4CQ9C0C4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA4CQ9C0C4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA4CQ9C0C4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA4CQ9C0C4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA4CQ9C0C4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA4CQ9C0C4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA4CQ9C0C4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4CQ9C0C4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SEMA4CQ9C0C4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4CQ9C0C4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4CQ9C0C4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4CQ9C0C4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4CQ9C0C4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4CQ9C0C4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4CQ9C0C4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4CQ9C0C4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4CQ9C0C4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4CQ9C0C4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4CQ9C0C4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4CQ9C0C4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4CQ9C0C4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4CQ9C0C4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA4CQ9C0C4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA4CQ9C0C4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4CQ9C0C4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4CQ9C0C4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4CQ9C0C4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4CQ9C0C4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA4CQ9C0C4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA4CQ9C0C4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA4CQ9C0C4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA4CQ9C0C4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA4CQ9C0C4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms