Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
PHF23Q9BUL5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PHF23Q9BUL5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PHF23Q9BUL5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PHF23Q9BUL5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
PHF23Q9BUL5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PHF23Q9BUL5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PHF23Q9BUL5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PHF23Q9BUL5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PHF23Q9BUL5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PHF23Q9BUL5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
PHF23Q9BUL5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PHF23Q9BUL5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PHF23Q9BUL5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41■■■■■ 4.15
PHF23Q9BUL5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PHF23Q9BUL5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PHF23Q9BUL5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
PHF23Q9BUL5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PHF23Q9BUL5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
PHF23Q9BUL5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
PHF23Q9BUL5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PHF23Q9BUL5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PHF23Q9BUL5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PHF23Q9BUL5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PHF23Q9BUL5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
PHF23Q9BUL5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
PHF23Q9BUL5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PHF23Q9BUL5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
PHF23Q9BUL5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PHF23Q9BUL5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PHF23Q9BUL5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PHF23Q9BUL5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PHF23Q9BUL5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PHF23Q9BUL5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PHF23Q9BUL5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PHF23Q9BUL5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
PHF23Q9BUL5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PHF23Q9BUL5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PHF23Q9BUL5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PHF23Q9BUL5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
PHF23Q9BUL5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PHF23Q9BUL5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PHF23Q9BUL5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PHF23Q9BUL5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
PHF23Q9BUL5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PHF23Q9BUL5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PHF23Q9BUL5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PHF23Q9BUL5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PHF23Q9BUL5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PHF23Q9BUL5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PHF23Q9BUL5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PHF23Q9BUL5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PHF23Q9BUL5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PHF23Q9BUL5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
PHF23Q9BUL5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PHF23Q9BUL5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PHF23Q9BUL5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PHF23Q9BUL5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PHF23Q9BUL5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PHF23Q9BUL5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PHF23Q9BUL5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PHF23Q9BUL5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PHF23Q9BUL5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PHF23Q9BUL5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PHF23Q9BUL5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PHF23Q9BUL5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PHF23Q9BUL5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PHF23Q9BUL5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PHF23Q9BUL5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PHF23Q9BUL5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PHF23Q9BUL5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PHF23Q9BUL5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
PHF23Q9BUL5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
PHF23Q9BUL5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PHF23Q9BUL5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
PHF23Q9BUL5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.03■■■■■ 4
PHF23Q9BUL5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PHF23Q9BUL5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PHF23Q9BUL5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PHF23Q9BUL5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
PHF23Q9BUL5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PHF23Q9BUL5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PHF23Q9BUL5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PHF23Q9BUL5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PHF23Q9BUL5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PHF23Q9BUL5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
PHF23Q9BUL5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PHF23Q9BUL5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PHF23Q9BUL5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PHF23Q9BUL5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PHF23Q9BUL5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PHF23Q9BUL5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PHF23Q9BUL5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
PHF23Q9BUL5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PHF23Q9BUL5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
PHF23Q9BUL5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PHF23Q9BUL5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PHF23Q9BUL5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PHF23Q9BUL5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PHF23Q9BUL5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms