Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VRK1Q99986 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VRK1Q99986 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VRK1Q99986 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VRK1Q99986 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VRK1Q99986 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VRK1Q99986 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VRK1Q99986 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VRK1Q99986 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VRK1Q99986 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VRK1Q99986 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VRK1Q99986 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VRK1Q99986 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VRK1Q99986 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VRK1Q99986 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VRK1Q99986 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VRK1Q99986 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VRK1Q99986 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VRK1Q99986 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VRK1Q99986 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VRK1Q99986 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VRK1Q99986 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VRK1Q99986 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VRK1Q99986 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VRK1Q99986 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VRK1Q99986 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VRK1Q99986 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VRK1Q99986 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VRK1Q99986 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VRK1Q99986 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VRK1Q99986 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VRK1Q99986 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VRK1Q99986 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VRK1Q99986 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VRK1Q99986 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VRK1Q99986 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VRK1Q99986 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VRK1Q99986 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VRK1Q99986 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VRK1Q99986 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VRK1Q99986 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VRK1Q99986 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VRK1Q99986 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VRK1Q99986 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VRK1Q99986 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VRK1Q99986 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VRK1Q99986 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VRK1Q99986 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VRK1Q99986 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VRK1Q99986 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VRK1Q99986 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VRK1Q99986 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VRK1Q99986 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VRK1Q99986 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VRK1Q99986 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VRK1Q99986 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VRK1Q99986 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VRK1Q99986 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VRK1Q99986 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VRK1Q99986 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VRK1Q99986 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VRK1Q99986 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VRK1Q99986 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VRK1Q99986 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VRK1Q99986 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VRK1Q99986 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VRK1Q99986 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VRK1Q99986 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VRK1Q99986 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VRK1Q99986 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VRK1Q99986 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VRK1Q99986 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VRK1Q99986 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VRK1Q99986 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRK1Q99986 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VRK1Q99986 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VRK1Q99986 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VRK1Q99986 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VRK1Q99986 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms