Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARID3AQ99856 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ARID3AQ99856 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ARID3AQ99856 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARID3AQ99856 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARID3AQ99856 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARID3AQ99856 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
ARID3AQ99856 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ARID3AQ99856 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ARID3AQ99856 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ARID3AQ99856 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ARID3AQ99856 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ARID3AQ99856 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ARID3AQ99856 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ARID3AQ99856 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ARID3AQ99856 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ARID3AQ99856 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ARID3AQ99856 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ARID3AQ99856 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ARID3AQ99856 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ARID3AQ99856 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3AQ99856 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3AQ99856 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3AQ99856 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3AQ99856 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3AQ99856 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ARID3AQ99856 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ARID3AQ99856 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ARID3AQ99856 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARID3AQ99856 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3AQ99856 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3AQ99856 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3AQ99856 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARID3AQ99856 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3AQ99856 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3AQ99856 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ARID3AQ99856 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ARID3AQ99856 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ARID3AQ99856 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARID3AQ99856 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARID3AQ99856 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ARID3AQ99856 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ARID3AQ99856 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ARID3AQ99856 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ARID3AQ99856 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARID3AQ99856 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARID3AQ99856 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARID3AQ99856 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ARID3AQ99856 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARID3AQ99856 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARID3AQ99856 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARID3AQ99856 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARID3AQ99856 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARID3AQ99856 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARID3AQ99856 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ARID3AQ99856 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARID3AQ99856 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARID3AQ99856 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARID3AQ99856 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARID3AQ99856 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3AQ99856 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARID3AQ99856 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3AQ99856 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3AQ99856 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3AQ99856 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3AQ99856 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3AQ99856 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3AQ99856 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3AQ99856 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3AQ99856 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3AQ99856 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3AQ99856 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARID3AQ99856 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARID3AQ99856 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3AQ99856 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARID3AQ99856 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3AQ99856 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARID3AQ99856 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3AQ99856 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3AQ99856 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3AQ99856 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3AQ99856 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3AQ99856 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3AQ99856 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3AQ99856 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3AQ99856 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3AQ99856 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3AQ99856 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3AQ99856 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms