Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMF1Q96S06 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMF1Q96S06 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMF1Q96S06 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMF1Q96S06 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMF1Q96S06 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMF1Q96S06 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMF1Q96S06 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMF1Q96S06 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMF1Q96S06 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMF1Q96S06 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMF1Q96S06 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMF1Q96S06 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMF1Q96S06 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMF1Q96S06 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMF1Q96S06 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMF1Q96S06 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMF1Q96S06 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMF1Q96S06 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMF1Q96S06 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMF1Q96S06 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMF1Q96S06 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMF1Q96S06 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMF1Q96S06 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMF1Q96S06 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMF1Q96S06 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMF1Q96S06 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMF1Q96S06 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMF1Q96S06 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMF1Q96S06 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMF1Q96S06 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMF1Q96S06 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMF1Q96S06 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMF1Q96S06 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMF1Q96S06 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMF1Q96S06 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMF1Q96S06 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMF1Q96S06 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMF1Q96S06 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMF1Q96S06 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMF1Q96S06 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMF1Q96S06 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMF1Q96S06 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMF1Q96S06 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMF1Q96S06 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMF1Q96S06 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMF1Q96S06 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMF1Q96S06 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMF1Q96S06 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMF1Q96S06 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMF1Q96S06 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMF1Q96S06 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMF1Q96S06 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMF1Q96S06 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMF1Q96S06 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMF1Q96S06 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMF1Q96S06 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMF1Q96S06 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMF1Q96S06 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMF1Q96S06 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMF1Q96S06 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMF1Q96S06 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMF1Q96S06 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMF1Q96S06 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMF1Q96S06 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMF1Q96S06 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMF1Q96S06 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMF1Q96S06 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMF1Q96S06 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMF1Q96S06 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMF1Q96S06 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMF1Q96S06 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMF1Q96S06 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMF1Q96S06 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMF1Q96S06 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMF1Q96S06 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMF1Q96S06 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMF1Q96S06 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms