Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBP5Q96PP8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GBP5Q96PP8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP5Q96PP8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP5Q96PP8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP5Q96PP8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP5Q96PP8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP5Q96PP8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP5Q96PP8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GBP5Q96PP8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP5Q96PP8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP5Q96PP8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP5Q96PP8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP5Q96PP8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP5Q96PP8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP5Q96PP8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBP5Q96PP8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP5Q96PP8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GBP5Q96PP8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP5Q96PP8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GBP5Q96PP8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP5Q96PP8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP5Q96PP8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP5Q96PP8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP5Q96PP8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP5Q96PP8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP5Q96PP8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GBP5Q96PP8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP5Q96PP8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP5Q96PP8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP5Q96PP8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP5Q96PP8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP5Q96PP8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP5Q96PP8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP5Q96PP8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP5Q96PP8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP5Q96PP8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP5Q96PP8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP5Q96PP8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP5Q96PP8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP5Q96PP8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP5Q96PP8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP5Q96PP8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP5Q96PP8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP5Q96PP8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBP5Q96PP8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBP5Q96PP8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP5Q96PP8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP5Q96PP8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GBP5Q96PP8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GBP5Q96PP8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GBP5Q96PP8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GBP5Q96PP8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP5Q96PP8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GBP5Q96PP8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP5Q96PP8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GBP5Q96PP8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GBP5Q96PP8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP5Q96PP8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP5Q96PP8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP5Q96PP8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP5Q96PP8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP5Q96PP8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP5Q96PP8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP5Q96PP8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP5Q96PP8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP5Q96PP8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP5Q96PP8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP5Q96PP8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP5Q96PP8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP5Q96PP8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP5Q96PP8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP5Q96PP8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GBP5Q96PP8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP5Q96PP8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP5Q96PP8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP5Q96PP8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP5Q96PP8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP5Q96PP8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP5Q96PP8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP5Q96PP8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP5Q96PP8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP5Q96PP8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP5Q96PP8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP5Q96PP8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP5Q96PP8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP5Q96PP8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP5Q96PP8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP5Q96PP8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP5Q96PP8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms