Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
JPH4Q96JJ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
JPH4Q96JJ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
JPH4Q96JJ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC48.29■■■■■ 5.32
JPH4Q96JJ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC48.26■■■■■ 5.32
JPH4Q96JJ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
JPH4Q96JJ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC48.24■■■■■ 5.31
JPH4Q96JJ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC48.19■■■■■ 5.3
JPH4Q96JJ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC48.14■■■■■ 5.3
JPH4Q96JJ6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.1■■■■■ 5.29
JPH4Q96JJ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
JPH4Q96JJ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
JPH4Q96JJ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.03■■■■■ 5.28
JPH4Q96JJ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
JPH4Q96JJ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
JPH4Q96JJ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC47.84■■■■■ 5.25
JPH4Q96JJ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
JPH4Q96JJ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC47.78■■■■■ 5.24
JPH4Q96JJ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
JPH4Q96JJ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
JPH4Q96JJ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC47.69■■■■■ 5.22
JPH4Q96JJ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC47.67■■■■■ 5.22
JPH4Q96JJ6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
JPH4Q96JJ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC47.65■■■■■ 5.22
JPH4Q96JJ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
JPH4Q96JJ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.61■■■■■ 5.21
JPH4Q96JJ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
JPH4Q96JJ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC47.57■■■■■ 5.21
JPH4Q96JJ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
JPH4Q96JJ6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
JPH4Q96JJ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
JPH4Q96JJ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
JPH4Q96JJ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC47.48■■■■■ 5.19
JPH4Q96JJ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
JPH4Q96JJ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
JPH4Q96JJ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
JPH4Q96JJ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
JPH4Q96JJ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
JPH4Q96JJ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC47.32■■■■■ 5.17
JPH4Q96JJ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
JPH4Q96JJ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
JPH4Q96JJ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
JPH4Q96JJ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
JPH4Q96JJ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
JPH4Q96JJ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC47.26■■■■■ 5.16
JPH4Q96JJ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
JPH4Q96JJ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC47.22■■■■■ 5.15
JPH4Q96JJ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
JPH4Q96JJ6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
JPH4Q96JJ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC47.17■■■■■ 5.14
JPH4Q96JJ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC47.14■■■■■ 5.14
JPH4Q96JJ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
JPH4Q96JJ6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
JPH4Q96JJ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
JPH4Q96JJ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
JPH4Q96JJ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
JPH4Q96JJ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
JPH4Q96JJ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
JPH4Q96JJ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC46.88■■■■■ 5.1
JPH4Q96JJ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
JPH4Q96JJ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC46.83■■■■■ 5.09
JPH4Q96JJ6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
JPH4Q96JJ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
JPH4Q96JJ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC46.81■■■■■ 5.08
JPH4Q96JJ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
JPH4Q96JJ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
JPH4Q96JJ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.75■■■■■ 5.07
JPH4Q96JJ6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
JPH4Q96JJ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
JPH4Q96JJ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
JPH4Q96JJ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
JPH4Q96JJ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
JPH4Q96JJ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
JPH4Q96JJ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
JPH4Q96JJ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
JPH4Q96JJ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
JPH4Q96JJ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
JPH4Q96JJ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
JPH4Q96JJ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
JPH4Q96JJ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.51■■■■■ 5.04
JPH4Q96JJ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
JPH4Q96JJ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC46.47■■■■■ 5.03
JPH4Q96JJ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
JPH4Q96JJ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
JPH4Q96JJ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
JPH4Q96JJ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
JPH4Q96JJ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
JPH4Q96JJ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
JPH4Q96JJ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.02
JPH4Q96JJ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
JPH4Q96JJ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
JPH4Q96JJ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
JPH4Q96JJ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
JPH4Q96JJ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.31■■■■■ 5
JPH4Q96JJ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
JPH4Q96JJ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
JPH4Q96JJ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
JPH4Q96JJ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
JPH4Q96JJ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
JPH4Q96JJ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms