Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3IP1Q96FE7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3IP1Q96FE7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3IP1Q96FE7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3IP1Q96FE7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3IP1Q96FE7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3IP1Q96FE7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3IP1Q96FE7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3IP1Q96FE7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3IP1Q96FE7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3IP1Q96FE7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3IP1Q96FE7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3IP1Q96FE7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3IP1Q96FE7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3IP1Q96FE7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3IP1Q96FE7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3IP1Q96FE7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3IP1Q96FE7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3IP1Q96FE7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3IP1Q96FE7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3IP1Q96FE7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3IP1Q96FE7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3IP1Q96FE7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3IP1Q96FE7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3IP1Q96FE7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3IP1Q96FE7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3IP1Q96FE7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3IP1Q96FE7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3IP1Q96FE7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3IP1Q96FE7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3IP1Q96FE7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3IP1Q96FE7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3IP1Q96FE7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3IP1Q96FE7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3IP1Q96FE7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3IP1Q96FE7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3IP1Q96FE7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3IP1Q96FE7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3IP1Q96FE7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3IP1Q96FE7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3IP1Q96FE7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3IP1Q96FE7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3IP1Q96FE7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3IP1Q96FE7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3IP1Q96FE7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3IP1Q96FE7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3IP1Q96FE7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3IP1Q96FE7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3IP1Q96FE7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3IP1Q96FE7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3IP1Q96FE7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3IP1Q96FE7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3IP1Q96FE7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3IP1Q96FE7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3IP1Q96FE7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3IP1Q96FE7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3IP1Q96FE7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3IP1Q96FE7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3IP1Q96FE7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3IP1Q96FE7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3IP1Q96FE7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3IP1Q96FE7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3IP1Q96FE7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3IP1Q96FE7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3IP1Q96FE7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3IP1Q96FE7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3IP1Q96FE7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3IP1Q96FE7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3IP1Q96FE7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3IP1Q96FE7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3IP1Q96FE7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3IP1Q96FE7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3IP1Q96FE7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3IP1Q96FE7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3IP1Q96FE7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3IP1Q96FE7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3IP1Q96FE7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3IP1Q96FE7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3IP1Q96FE7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIK3IP1Q96FE7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3IP1Q96FE7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3IP1Q96FE7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIK3IP1Q96FE7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIK3IP1Q96FE7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3IP1Q96FE7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIK3IP1Q96FE7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIK3IP1Q96FE7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3IP1Q96FE7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3IP1Q96FE7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3IP1Q96FE7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3IP1Q96FE7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3IP1Q96FE7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3IP1Q96FE7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3IP1Q96FE7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3IP1Q96FE7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3IP1Q96FE7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3IP1Q96FE7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3IP1Q96FE7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3IP1Q96FE7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3IP1Q96FE7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms