Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC74AQ96AQ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC74AQ96AQ1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC74AQ96AQ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC74AQ96AQ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC74AQ96AQ1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC74AQ96AQ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC74AQ96AQ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC74AQ96AQ1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC74AQ96AQ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC74AQ96AQ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC74AQ96AQ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC74AQ96AQ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC74AQ96AQ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC74AQ96AQ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC74AQ96AQ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC74AQ96AQ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC74AQ96AQ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC74AQ96AQ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC74AQ96AQ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC74AQ96AQ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC74AQ96AQ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC74AQ96AQ1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC74AQ96AQ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC74AQ96AQ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC74AQ96AQ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC74AQ96AQ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC74AQ96AQ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC74AQ96AQ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC74AQ96AQ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC74AQ96AQ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC74AQ96AQ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC74AQ96AQ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC74AQ96AQ1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC74AQ96AQ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC74AQ96AQ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC74AQ96AQ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC74AQ96AQ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC74AQ96AQ1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC74AQ96AQ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC74AQ96AQ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC74AQ96AQ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC74AQ96AQ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC74AQ96AQ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC74AQ96AQ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC74AQ96AQ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC74AQ96AQ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC74AQ96AQ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC74AQ96AQ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC74AQ96AQ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC74AQ96AQ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC74AQ96AQ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC74AQ96AQ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC74AQ96AQ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC74AQ96AQ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC74AQ96AQ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC74AQ96AQ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC74AQ96AQ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC74AQ96AQ1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC74AQ96AQ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC74AQ96AQ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC74AQ96AQ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC74AQ96AQ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC74AQ96AQ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC74AQ96AQ1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC74AQ96AQ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC74AQ96AQ1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC74AQ96AQ1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC74AQ96AQ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC74AQ96AQ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC74AQ96AQ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC74AQ96AQ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC74AQ96AQ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC74AQ96AQ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC74AQ96AQ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC74AQ96AQ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC74AQ96AQ1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC74AQ96AQ1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC74AQ96AQ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC74AQ96AQ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC74AQ96AQ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC74AQ96AQ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC74AQ96AQ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC74AQ96AQ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC74AQ96AQ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC74AQ96AQ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC74AQ96AQ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC74AQ96AQ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC74AQ96AQ1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC74AQ96AQ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC74AQ96AQ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC74AQ96AQ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC74AQ96AQ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC74AQ96AQ1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC74AQ96AQ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC74AQ96AQ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC74AQ96AQ1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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