Protein–RNA interactions for Protein: Q92982

NINJ1, Ninjurin-1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ1Q92982 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINJ1Q92982 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINJ1Q92982 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NINJ1Q92982 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINJ1Q92982 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINJ1Q92982 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NINJ1Q92982 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINJ1Q92982 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINJ1Q92982 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINJ1Q92982 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINJ1Q92982 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINJ1Q92982 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINJ1Q92982 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINJ1Q92982 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINJ1Q92982 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINJ1Q92982 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINJ1Q92982 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINJ1Q92982 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINJ1Q92982 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINJ1Q92982 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINJ1Q92982 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NINJ1Q92982 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NINJ1Q92982 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NINJ1Q92982 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NINJ1Q92982 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NINJ1Q92982 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NINJ1Q92982 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NINJ1Q92982 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NINJ1Q92982 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NINJ1Q92982 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ1Q92982 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ1Q92982 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NINJ1Q92982 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NINJ1Q92982 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NINJ1Q92982 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NINJ1Q92982 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NINJ1Q92982 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NINJ1Q92982 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINJ1Q92982 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINJ1Q92982 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINJ1Q92982 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINJ1Q92982 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINJ1Q92982 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NINJ1Q92982 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINJ1Q92982 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NINJ1Q92982 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NINJ1Q92982 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINJ1Q92982 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NINJ1Q92982 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINJ1Q92982 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NINJ1Q92982 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NINJ1Q92982 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NINJ1Q92982 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NINJ1Q92982 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NINJ1Q92982 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NINJ1Q92982 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NINJ1Q92982 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NINJ1Q92982 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NINJ1Q92982 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINJ1Q92982 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINJ1Q92982 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINJ1Q92982 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NINJ1Q92982 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NINJ1Q92982 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NINJ1Q92982 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NINJ1Q92982 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NINJ1Q92982 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NINJ1Q92982 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NINJ1Q92982 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NINJ1Q92982 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NINJ1Q92982 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NINJ1Q92982 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NINJ1Q92982 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NINJ1Q92982 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NINJ1Q92982 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NINJ1Q92982 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NINJ1Q92982 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NINJ1Q92982 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NINJ1Q92982 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NINJ1Q92982 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NINJ1Q92982 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINJ1Q92982 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINJ1Q92982 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINJ1Q92982 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ1Q92982 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ1Q92982 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINJ1Q92982 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NINJ1Q92982 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINJ1Q92982 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NINJ1Q92982 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINJ1Q92982 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NINJ1Q92982 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NINJ1Q92982 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ1Q92982 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ1Q92982 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NINJ1Q92982 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NINJ1Q92982 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ1Q92982 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ1Q92982 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NINJ1Q92982 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms