Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.9■■■■■ 4.94
NEO1Q92859 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
NEO1Q92859 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
NEO1Q92859 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
NEO1Q92859 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
NEO1Q92859 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
NEO1Q92859 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.73■■■■■ 4.91
NEO1Q92859 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
NEO1Q92859 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
NEO1Q92859 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
NEO1Q92859 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
NEO1Q92859 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
NEO1Q92859 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
NEO1Q92859 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
NEO1Q92859 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
NEO1Q92859 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
NEO1Q92859 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
NEO1Q92859 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.3■■■■■ 4.84
NEO1Q92859 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
NEO1Q92859 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
NEO1Q92859 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
NEO1Q92859 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
NEO1Q92859 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
NEO1Q92859 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
NEO1Q92859 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
NEO1Q92859 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
NEO1Q92859 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
NEO1Q92859 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
NEO1Q92859 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
NEO1Q92859 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
NEO1Q92859 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
NEO1Q92859 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
NEO1Q92859 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
NEO1Q92859 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
NEO1Q92859 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
NEO1Q92859 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
NEO1Q92859 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
NEO1Q92859 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC44.88■■■■■ 4.78
NEO1Q92859 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
NEO1Q92859 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
NEO1Q92859 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
NEO1Q92859 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
NEO1Q92859 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
NEO1Q92859 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
NEO1Q92859 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
NEO1Q92859 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
NEO1Q92859 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
NEO1Q92859 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
NEO1Q92859 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
NEO1Q92859 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
NEO1Q92859 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
NEO1Q92859 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
NEO1Q92859 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
NEO1Q92859 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
NEO1Q92859 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
NEO1Q92859 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
NEO1Q92859 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
NEO1Q92859 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
NEO1Q92859 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
NEO1Q92859 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
NEO1Q92859 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.46■■■■■ 4.71
NEO1Q92859 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
NEO1Q92859 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
NEO1Q92859 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
NEO1Q92859 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
NEO1Q92859 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
NEO1Q92859 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
NEO1Q92859 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
NEO1Q92859 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
NEO1Q92859 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
NEO1Q92859 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
NEO1Q92859 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NEO1Q92859 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NEO1Q92859 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
NEO1Q92859 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
NEO1Q92859 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
NEO1Q92859 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NEO1Q92859 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
NEO1Q92859 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NEO1Q92859 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NEO1Q92859 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
NEO1Q92859 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
NEO1Q92859 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
NEO1Q92859 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NEO1Q92859 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NEO1Q92859 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
NEO1Q92859 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.97■■■■■ 4.63
NEO1Q92859 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
NEO1Q92859 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.63
NEO1Q92859 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
NEO1Q92859 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
NEO1Q92859 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
NEO1Q92859 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
NEO1Q92859 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
NEO1Q92859 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
NEO1Q92859 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
NEO1Q92859 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
NEO1Q92859 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
NEO1Q92859 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
NEO1Q92859 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms