Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
CASKIN1Q8WXD9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.98
CASKIN1Q8WXD9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
CASKIN1Q8WXD9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
CASKIN1Q8WXD9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
CASKIN1Q8WXD9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
CASKIN1Q8WXD9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.91■■■■■ 4.94
CASKIN1Q8WXD9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
CASKIN1Q8WXD9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
CASKIN1Q8WXD9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
CASKIN1Q8WXD9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
CASKIN1Q8WXD9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
CASKIN1Q8WXD9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.93
CASKIN1Q8WXD9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
CASKIN1Q8WXD9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
CASKIN1Q8WXD9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CASKIN1Q8WXD9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.72■■■■■ 4.91
CASKIN1Q8WXD9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
CASKIN1Q8WXD9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.71■■■■■ 4.91
CASKIN1Q8WXD9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
CASKIN1Q8WXD9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
CASKIN1Q8WXD9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
CASKIN1Q8WXD9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
CASKIN1Q8WXD9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC45.6■■■■■ 4.89
CASKIN1Q8WXD9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
CASKIN1Q8WXD9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
CASKIN1Q8WXD9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
CASKIN1Q8WXD9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CASKIN1Q8WXD9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
CASKIN1Q8WXD9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CASKIN1Q8WXD9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CASKIN1Q8WXD9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.87
CASKIN1Q8WXD9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CASKIN1Q8WXD9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.85
CASKIN1Q8WXD9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
CASKIN1Q8WXD9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
CASKIN1Q8WXD9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CASKIN1Q8WXD9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CASKIN1Q8WXD9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
CASKIN1Q8WXD9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
CASKIN1Q8WXD9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
CASKIN1Q8WXD9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
CASKIN1Q8WXD9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
CASKIN1Q8WXD9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CASKIN1Q8WXD9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CASKIN1Q8WXD9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CASKIN1Q8WXD9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CASKIN1Q8WXD9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CASKIN1Q8WXD9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
CASKIN1Q8WXD9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
CASKIN1Q8WXD9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CASKIN1Q8WXD9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CASKIN1Q8WXD9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CASKIN1Q8WXD9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CASKIN1Q8WXD9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
CASKIN1Q8WXD9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
CASKIN1Q8WXD9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CASKIN1Q8WXD9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CASKIN1Q8WXD9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
CASKIN1Q8WXD9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
CASKIN1Q8WXD9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
CASKIN1Q8WXD9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
CASKIN1Q8WXD9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
CASKIN1Q8WXD9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CASKIN1Q8WXD9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
CASKIN1Q8WXD9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CASKIN1Q8WXD9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
CASKIN1Q8WXD9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
CASKIN1Q8WXD9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
CASKIN1Q8WXD9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
CASKIN1Q8WXD9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
CASKIN1Q8WXD9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
CASKIN1Q8WXD9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CASKIN1Q8WXD9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
CASKIN1Q8WXD9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
CASKIN1Q8WXD9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CASKIN1Q8WXD9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CASKIN1Q8WXD9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CASKIN1Q8WXD9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CASKIN1Q8WXD9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
CASKIN1Q8WXD9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CASKIN1Q8WXD9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
CASKIN1Q8WXD9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CASKIN1Q8WXD9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CASKIN1Q8WXD9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CASKIN1Q8WXD9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CASKIN1Q8WXD9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CASKIN1Q8WXD9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CASKIN1Q8WXD9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CASKIN1Q8WXD9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
CASKIN1Q8WXD9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
CASKIN1Q8WXD9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CASKIN1Q8WXD9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CASKIN1Q8WXD9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CASKIN1Q8WXD9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CASKIN1Q8WXD9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.7
CASKIN1Q8WXD9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
CASKIN1Q8WXD9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
CASKIN1Q8WXD9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
CASKIN1Q8WXD9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms