Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSMEM1Q8WWF3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSMEM1Q8WWF3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSMEM1Q8WWF3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSMEM1Q8WWF3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSMEM1Q8WWF3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSMEM1Q8WWF3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSMEM1Q8WWF3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSMEM1Q8WWF3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSMEM1Q8WWF3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSMEM1Q8WWF3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSMEM1Q8WWF3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSMEM1Q8WWF3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSMEM1Q8WWF3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSMEM1Q8WWF3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSMEM1Q8WWF3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SSMEM1Q8WWF3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSMEM1Q8WWF3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSMEM1Q8WWF3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSMEM1Q8WWF3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSMEM1Q8WWF3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSMEM1Q8WWF3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSMEM1Q8WWF3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSMEM1Q8WWF3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSMEM1Q8WWF3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSMEM1Q8WWF3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSMEM1Q8WWF3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSMEM1Q8WWF3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSMEM1Q8WWF3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSMEM1Q8WWF3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSMEM1Q8WWF3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSMEM1Q8WWF3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSMEM1Q8WWF3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSMEM1Q8WWF3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSMEM1Q8WWF3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSMEM1Q8WWF3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSMEM1Q8WWF3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSMEM1Q8WWF3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSMEM1Q8WWF3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSMEM1Q8WWF3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSMEM1Q8WWF3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSMEM1Q8WWF3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSMEM1Q8WWF3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSMEM1Q8WWF3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSMEM1Q8WWF3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSMEM1Q8WWF3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSMEM1Q8WWF3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSMEM1Q8WWF3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSMEM1Q8WWF3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSMEM1Q8WWF3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSMEM1Q8WWF3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSMEM1Q8WWF3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSMEM1Q8WWF3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSMEM1Q8WWF3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSMEM1Q8WWF3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSMEM1Q8WWF3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSMEM1Q8WWF3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSMEM1Q8WWF3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSMEM1Q8WWF3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSMEM1Q8WWF3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSMEM1Q8WWF3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSMEM1Q8WWF3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSMEM1Q8WWF3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSMEM1Q8WWF3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSMEM1Q8WWF3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSMEM1Q8WWF3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSMEM1Q8WWF3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSMEM1Q8WWF3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSMEM1Q8WWF3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSMEM1Q8WWF3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSMEM1Q8WWF3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSMEM1Q8WWF3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSMEM1Q8WWF3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSMEM1Q8WWF3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSMEM1Q8WWF3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSMEM1Q8WWF3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSMEM1Q8WWF3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSMEM1Q8WWF3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSMEM1Q8WWF3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms