Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSC4DQ8WTU2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSC4DQ8WTU2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSC4DQ8WTU2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSC4DQ8WTU2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSC4DQ8WTU2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSC4DQ8WTU2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSC4DQ8WTU2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSC4DQ8WTU2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSC4DQ8WTU2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSC4DQ8WTU2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSC4DQ8WTU2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSC4DQ8WTU2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSC4DQ8WTU2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SSC4DQ8WTU2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSC4DQ8WTU2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSC4DQ8WTU2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSC4DQ8WTU2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSC4DQ8WTU2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SSC4DQ8WTU2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSC4DQ8WTU2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSC4DQ8WTU2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSC4DQ8WTU2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSC4DQ8WTU2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SSC4DQ8WTU2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSC4DQ8WTU2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SSC4DQ8WTU2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSC4DQ8WTU2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSC4DQ8WTU2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSC4DQ8WTU2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSC4DQ8WTU2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSC4DQ8WTU2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSC4DQ8WTU2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC4DQ8WTU2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SSC4DQ8WTU2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SSC4DQ8WTU2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC4DQ8WTU2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSC4DQ8WTU2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSC4DQ8WTU2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSC4DQ8WTU2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSC4DQ8WTU2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSC4DQ8WTU2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSC4DQ8WTU2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSC4DQ8WTU2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSC4DQ8WTU2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSC4DQ8WTU2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSC4DQ8WTU2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSC4DQ8WTU2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSC4DQ8WTU2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSC4DQ8WTU2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSC4DQ8WTU2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSC4DQ8WTU2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSC4DQ8WTU2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSC4DQ8WTU2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSC4DQ8WTU2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSC4DQ8WTU2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSC4DQ8WTU2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSC4DQ8WTU2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSC4DQ8WTU2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSC4DQ8WTU2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSC4DQ8WTU2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSC4DQ8WTU2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSC4DQ8WTU2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSC4DQ8WTU2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSC4DQ8WTU2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSC4DQ8WTU2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSC4DQ8WTU2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSC4DQ8WTU2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSC4DQ8WTU2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSC4DQ8WTU2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSC4DQ8WTU2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSC4DQ8WTU2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSC4DQ8WTU2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSC4DQ8WTU2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SSC4DQ8WTU2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSC4DQ8WTU2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSC4DQ8WTU2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSC4DQ8WTU2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSC4DQ8WTU2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSC4DQ8WTU2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SSC4DQ8WTU2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSC4DQ8WTU2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSC4DQ8WTU2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSC4DQ8WTU2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSC4DQ8WTU2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SSC4DQ8WTU2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSC4DQ8WTU2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSC4DQ8WTU2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSC4DQ8WTU2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSC4DQ8WTU2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SSC4DQ8WTU2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSC4DQ8WTU2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSC4DQ8WTU2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSC4DQ8WTU2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSC4DQ8WTU2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSC4DQ8WTU2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SSC4DQ8WTU2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSC4DQ8WTU2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC4DQ8WTU2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSC4DQ8WTU2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
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