Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBM7

TMEM254, Transmembrane protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM254Q8TBM7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM254Q8TBM7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM254Q8TBM7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM254Q8TBM7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM254Q8TBM7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM254Q8TBM7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM254Q8TBM7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM254Q8TBM7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM254Q8TBM7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM254Q8TBM7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM254Q8TBM7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM254Q8TBM7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM254Q8TBM7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM254Q8TBM7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM254Q8TBM7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM254Q8TBM7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM254Q8TBM7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM254Q8TBM7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM254Q8TBM7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM254Q8TBM7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM254Q8TBM7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM254Q8TBM7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM254Q8TBM7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM254Q8TBM7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM254Q8TBM7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM254Q8TBM7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM254Q8TBM7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM254Q8TBM7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM254Q8TBM7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM254Q8TBM7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM254Q8TBM7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM254Q8TBM7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM254Q8TBM7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM254Q8TBM7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM254Q8TBM7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM254Q8TBM7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM254Q8TBM7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM254Q8TBM7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM254Q8TBM7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM254Q8TBM7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM254Q8TBM7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM254Q8TBM7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms