Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RIN3Q8TB24 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RIN3Q8TB24 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RIN3Q8TB24 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RIN3Q8TB24 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RIN3Q8TB24 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RIN3Q8TB24 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RIN3Q8TB24 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RIN3Q8TB24 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RIN3Q8TB24 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RIN3Q8TB24 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RIN3Q8TB24 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RIN3Q8TB24 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RIN3Q8TB24 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RIN3Q8TB24 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RIN3Q8TB24 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RIN3Q8TB24 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RIN3Q8TB24 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RIN3Q8TB24 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RIN3Q8TB24 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RIN3Q8TB24 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RIN3Q8TB24 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RIN3Q8TB24 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RIN3Q8TB24 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RIN3Q8TB24 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RIN3Q8TB24 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RIN3Q8TB24 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RIN3Q8TB24 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RIN3Q8TB24 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RIN3Q8TB24 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RIN3Q8TB24 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RIN3Q8TB24 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIN3Q8TB24 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIN3Q8TB24 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RIN3Q8TB24 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RIN3Q8TB24 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIN3Q8TB24 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIN3Q8TB24 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIN3Q8TB24 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RIN3Q8TB24 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIN3Q8TB24 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIN3Q8TB24 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIN3Q8TB24 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIN3Q8TB24 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIN3Q8TB24 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIN3Q8TB24 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RIN3Q8TB24 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIN3Q8TB24 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIN3Q8TB24 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIN3Q8TB24 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIN3Q8TB24 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RIN3Q8TB24 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIN3Q8TB24 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIN3Q8TB24 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIN3Q8TB24 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIN3Q8TB24 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIN3Q8TB24 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIN3Q8TB24 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIN3Q8TB24 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIN3Q8TB24 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RIN3Q8TB24 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RIN3Q8TB24 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RIN3Q8TB24 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RIN3Q8TB24 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIN3Q8TB24 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIN3Q8TB24 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RIN3Q8TB24 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIN3Q8TB24 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIN3Q8TB24 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RIN3Q8TB24 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RIN3Q8TB24 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIN3Q8TB24 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RIN3Q8TB24 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIN3Q8TB24 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RIN3Q8TB24 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RIN3Q8TB24 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RIN3Q8TB24 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RIN3Q8TB24 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIN3Q8TB24 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIN3Q8TB24 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RIN3Q8TB24 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RIN3Q8TB24 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIN3Q8TB24 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RIN3Q8TB24 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RIN3Q8TB24 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RIN3Q8TB24 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RIN3Q8TB24 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RIN3Q8TB24 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIN3Q8TB24 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIN3Q8TB24 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIN3Q8TB24 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIN3Q8TB24 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIN3Q8TB24 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIN3Q8TB24 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIN3Q8TB24 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIN3Q8TB24 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIN3Q8TB24 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIN3Q8TB24 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIN3Q8TB24 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIN3Q8TB24 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms