Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf43Q8TAL5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf43Q8TAL5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf43Q8TAL5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf43Q8TAL5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9orf43Q8TAL5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf43Q8TAL5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf43Q8TAL5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf43Q8TAL5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf43Q8TAL5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf43Q8TAL5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf43Q8TAL5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf43Q8TAL5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9orf43Q8TAL5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf43Q8TAL5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf43Q8TAL5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf43Q8TAL5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf43Q8TAL5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf43Q8TAL5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf43Q8TAL5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf43Q8TAL5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf43Q8TAL5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf43Q8TAL5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf43Q8TAL5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf43Q8TAL5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf43Q8TAL5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf43Q8TAL5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf43Q8TAL5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf43Q8TAL5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf43Q8TAL5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C9orf43Q8TAL5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf43Q8TAL5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C9orf43Q8TAL5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf43Q8TAL5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf43Q8TAL5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf43Q8TAL5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf43Q8TAL5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf43Q8TAL5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf43Q8TAL5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9orf43Q8TAL5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf43Q8TAL5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf43Q8TAL5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf43Q8TAL5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf43Q8TAL5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf43Q8TAL5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf43Q8TAL5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf43Q8TAL5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf43Q8TAL5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf43Q8TAL5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf43Q8TAL5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C9orf43Q8TAL5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9orf43Q8TAL5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf43Q8TAL5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf43Q8TAL5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf43Q8TAL5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf43Q8TAL5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf43Q8TAL5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9orf43Q8TAL5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9orf43Q8TAL5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C9orf43Q8TAL5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf43Q8TAL5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf43Q8TAL5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf43Q8TAL5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf43Q8TAL5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf43Q8TAL5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf43Q8TAL5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf43Q8TAL5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf43Q8TAL5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf43Q8TAL5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf43Q8TAL5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf43Q8TAL5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf43Q8TAL5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf43Q8TAL5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf43Q8TAL5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf43Q8TAL5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf43Q8TAL5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf43Q8TAL5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C9orf43Q8TAL5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C9orf43Q8TAL5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C9orf43Q8TAL5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C9orf43Q8TAL5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C9orf43Q8TAL5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
C9orf43Q8TAL5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C9orf43Q8TAL5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9orf43Q8TAL5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C9orf43Q8TAL5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C9orf43Q8TAL5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C9orf43Q8TAL5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C9orf43Q8TAL5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C9orf43Q8TAL5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C9orf43Q8TAL5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C9orf43Q8TAL5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C9orf43Q8TAL5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C9orf43Q8TAL5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C9orf43Q8TAL5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C9orf43Q8TAL5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms