Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
USP32Q8NFA0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
USP32Q8NFA0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
USP32Q8NFA0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
USP32Q8NFA0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
USP32Q8NFA0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
USP32Q8NFA0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
USP32Q8NFA0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
USP32Q8NFA0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
USP32Q8NFA0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
USP32Q8NFA0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
USP32Q8NFA0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
USP32Q8NFA0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
USP32Q8NFA0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
USP32Q8NFA0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
USP32Q8NFA0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
USP32Q8NFA0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
USP32Q8NFA0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
USP32Q8NFA0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
USP32Q8NFA0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
USP32Q8NFA0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
USP32Q8NFA0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
USP32Q8NFA0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
USP32Q8NFA0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
USP32Q8NFA0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
USP32Q8NFA0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
USP32Q8NFA0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
USP32Q8NFA0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
USP32Q8NFA0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
USP32Q8NFA0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
USP32Q8NFA0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
USP32Q8NFA0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
USP32Q8NFA0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
USP32Q8NFA0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
USP32Q8NFA0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
USP32Q8NFA0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
USP32Q8NFA0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
USP32Q8NFA0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
USP32Q8NFA0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.2■■■■■ 4.03
USP32Q8NFA0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
USP32Q8NFA0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
USP32Q8NFA0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
USP32Q8NFA0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
USP32Q8NFA0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
USP32Q8NFA0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
USP32Q8NFA0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
USP32Q8NFA0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
USP32Q8NFA0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.06■■■■■ 4
USP32Q8NFA0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
USP32Q8NFA0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
USP32Q8NFA0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
USP32Q8NFA0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
USP32Q8NFA0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
USP32Q8NFA0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
USP32Q8NFA0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
USP32Q8NFA0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
USP32Q8NFA0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
USP32Q8NFA0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
USP32Q8NFA0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
USP32Q8NFA0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
USP32Q8NFA0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
USP32Q8NFA0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
USP32Q8NFA0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
USP32Q8NFA0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
USP32Q8NFA0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
USP32Q8NFA0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
USP32Q8NFA0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
USP32Q8NFA0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
USP32Q8NFA0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
USP32Q8NFA0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
USP32Q8NFA0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
USP32Q8NFA0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
USP32Q8NFA0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
USP32Q8NFA0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
USP32Q8NFA0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
USP32Q8NFA0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
USP32Q8NFA0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
USP32Q8NFA0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
USP32Q8NFA0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
USP32Q8NFA0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
USP32Q8NFA0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.91
USP32Q8NFA0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
USP32Q8NFA0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
USP32Q8NFA0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
USP32Q8NFA0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
USP32Q8NFA0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
USP32Q8NFA0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
USP32Q8NFA0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
USP32Q8NFA0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
USP32Q8NFA0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms